Protein–RNA interactions for Protein: Q61221

Hif1a, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif1aQ61221 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hif1aQ61221 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms