Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mre11Q61216 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mre11Q61216 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mre11Q61216 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mre11Q61216 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mre11Q61216 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mre11Q61216 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mre11Q61216 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mre11Q61216 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mre11Q61216 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mre11Q61216 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mre11Q61216 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mre11Q61216 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mre11Q61216 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mre11Q61216 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mre11Q61216 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mre11Q61216 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mre11Q61216 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Mre11Q61216 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mre11Q61216 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mre11Q61216 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mre11Q61216 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms