Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ift20Q61025 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ift20Q61025 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms