Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Rbbp4Q60972 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms