Protein–RNA interactions for Protein: Q60948

Mxd4, Max dimerization protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mxd4Q60948 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mxd4Q60948 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mxd4Q60948 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mxd4Q60948 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mxd4Q60948 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mxd4Q60948 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mxd4Q60948 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mxd4Q60948 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mxd4Q60948 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mxd4Q60948 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mxd4Q60948 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mxd4Q60948 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mxd4Q60948 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mxd4Q60948 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mxd4Q60948 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mxd4Q60948 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mxd4Q60948 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mxd4Q60948 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mxd4Q60948 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms