Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk2a1Q60737 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms