Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprnQ60673 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms