Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prdm1Q60636 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prdm1Q60636 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms