Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema5bQ60519 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms