Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ankrd40Q5SUE8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms