Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf215Q5SPX3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf215Q5SPX3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms