Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RilpQ5ND29 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RilpQ5ND29 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms