Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJS3

Fam20c, Extracellular serine/threonine protein kinase FAM20C, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20cQ5MJS3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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