Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps41Q5KU39 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms