Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SynaQ5G5D5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SynaQ5G5D5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SynaQ5G5D5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SynaQ5G5D5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SynaQ5G5D5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SynaQ5G5D5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SynaQ5G5D5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SynaQ5G5D5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms