Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Nlrc3Q5DU56 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Nlrc3Q5DU56 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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