Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Spag9Q58A65 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spag9Q58A65 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spag9Q58A65 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spag9Q58A65 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spag9Q58A65 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spag9Q58A65 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spag9Q58A65 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms