Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Spire1Q52KF3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms