Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhox3aQ4TU90 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms