Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

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Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Snx25Q3ZT31 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx25Q3ZT31 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms