Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Afg1lQ3V384 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms