Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ckap2Q3V1H1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ckap2Q3V1H1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms