Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnah12Q3V0Q1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dnah12Q3V0Q1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Dnah12Q3V0Q1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dnah12Q3V0Q1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dnah12Q3V0Q1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dnah12Q3V0Q1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dnah12Q3V0Q1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dnah12Q3V0Q1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnah12Q3V0Q1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnah12Q3V0Q1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms