Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc43Q3V0L5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms