Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3V0E1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3V0E1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3V0E1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms