Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Trim80Q3V061 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim80Q3V061 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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