Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ttc9Q3V038 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc9Q3V038 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms