Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tmed1Q3V009 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed1Q3V009 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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