Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E330034G19RikQ3UWX6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms