Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnga4Q3UW12 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnga4Q3UW12 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnga4Q3UW12 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnga4Q3UW12 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnga4Q3UW12 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnga4Q3UW12 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms