Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS3

Drc1, Dynein regulatory complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Drc1Q3USS3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Drc1Q3USS3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms