Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm28047Q3US59 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm28047Q3US59 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms