Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Znf48Q3US17 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms