Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp560Q3URI6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms