Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sec31aQ3UPL0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sec31aQ3UPL0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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