Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem253Q3UNB8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms