Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms