Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrch2Q3UMG5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrch2Q3UMG5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms