Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcgf5Q3UK78 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcgf5Q3UK78 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms