Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmod2Q3UHZ5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmod2Q3UHZ5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmod2Q3UHZ5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmod2Q3UHZ5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmod2Q3UHZ5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmod2Q3UHZ5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmod2Q3UHZ5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmod2Q3UHZ5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmod2Q3UHZ5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmod2Q3UHZ5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmod2Q3UHZ5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmod2Q3UHZ5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmod2Q3UHZ5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmod2Q3UHZ5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmod2Q3UHZ5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms