Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nkx6-3Q3UHX8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nkx6-3Q3UHX8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nkx6-3Q3UHX8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nkx6-3Q3UHX8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nkx6-3Q3UHX8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Nkx6-3Q3UHX8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Nkx6-3Q3UHX8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nkx6-3Q3UHX8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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