Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trafd1Q3UDK1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms