Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pid1Q3UBG2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms