Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssbp4Q3U4B1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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