Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ulk3Q3U3Q1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms