Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gse1Q3U3C9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms