Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdkl4Q3TZA2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdkl4Q3TZA2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms