Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR2

Pdss1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1Q33DR2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdss1Q33DR2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms