Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN8

Defb25, Beta-defensin 25, mousemouse

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb25Q30KN8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Defb25Q30KN8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Defb25Q30KN8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Defb25Q30KN8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Defb25Q30KN8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb25Q30KN8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Defb25Q30KN8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defb25Q30KN8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defb25Q30KN8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defb25Q30KN8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defb25Q30KN8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defb25Q30KN8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Defb25Q30KN8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb25Q30KN8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb25Q30KN8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb25Q30KN8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb25Q30KN8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb25Q30KN8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb25Q30KN8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb25Q30KN8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb25Q30KN8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb25Q30KN8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb25Q30KN8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb25Q30KN8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb25Q30KN8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb25Q30KN8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb25Q30KN8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defb25Q30KN8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defb25Q30KN8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defb25Q30KN8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defb25Q30KN8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Defb25Q30KN8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defb25Q30KN8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms