Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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Shroom4Q1W617 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
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Shroom4Q1W617 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
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Shroom4Q1W617 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
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Shroom4Q1W617 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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Shroom4Q1W617 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Shroom4Q1W617 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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Shroom4Q1W617 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shroom4Q1W617 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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